员工发现店长贪污，应当进行举报。以下是具体的分析：

1. 法律义务与道德责任：

   • 作为员工，发现店长贪污行为，从法律角度讲，可能涉及到对违法行为的知情不报问题。虽然普通员工可能不直接承担法律责任，但从道德和职业操守上讲，举报贪污行为是维护公司利益、遵守职业道德的体现。
   • 贪污行为损害了公司的财产权益，也可能影响到其他员工的切身利益，如工资、福利等。因此，举报贪污不仅是对公司负责，也是对全体员工负责。

2. 举报途径与方式：

   • 员工可以选择向公司内部的监察部门、财务部门或高层管理人员进行举报。这些部门通常负责处理公司内部的违规违纪行为。
   • 如果公司内部无法有效处理或员工担心受到打击报复，可以向外部监管机构（如工商行政管理部门、税务部门等）或公安机关进行举报。
   • 在举报时，员工应尽可能提供详实的证据材料，如贪污行为的记录、凭证、交易记录等，以便相关部门进行调查取证。

3. 举报后的可能后果：

   • 如果举报属实，公司或监管机构可能会对店长进行相应的处理，包括但不限于开除、罚款、追究法律责任等。
   • 员工举报可能会受到公司的保护，避免遭受打击报复。如果员工因举报而受到不公正待遇，可以寻求法律援助或向相关部门投诉。

4. 注意事项：

   • 在举报前，员工应确保自己掌握的证据真实可靠，避免误告或诬告。
   • 举报时应保持冷静和客观，避免情绪化或偏激的言辞。
   • 员工应了解自己的权利和义务，避免在举报过程中受到不必要的侵害。

综上所述，员工发现店长贪污时，应当积极履行举报义务，维护公司利益和职业道德。在举报过程中，应注意保护自己的合法权益，确保举报行为的合法性和有效性。如果你在这个过程中有任何法律问题或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。