探亲假一年内夫妻双方一般不可以不同时间休。以下是对此问题的详细分析：
一、政策规定与解读
根据《国务院关于职工探亲待遇的规定》，已婚职工探望父母的探亲假是每四年给予一次，假期为二十天。这一规定是基于职工与配偶共同生活的假设，即夫妻双方应作为一个整体来考虑探亲假的安排。因此，从政策层面来看，并没有明确允许夫妻分别休探亲假。
二、实际操作中的考虑
假期性质：探亲假是为了解决职工与配偶、父母团聚的问题而设立的，其性质决定了它通常是由一方享受，而不是双方各自享受。这是因为探亲假的目的在于促进家庭团聚，而非提供额外的休假机会。
单位管理：在实际操作中，单位会根据职工的实际情况和需要来安排探亲假，以确保工作的正常进行。如果允许夫妻分别休探亲假，可能会给单位的管理带来不便，也可能导致部分职工滥用探亲假，从而影响工作秩序和效率。
公平性原则：探亲假的设置需要考虑到公平性。如果允许夫妻分别休探亲假，那么对于其他未婚或离异等没有配偶的职工来说，可能会感觉不公平。因为他们在享受探亲假时无法像已婚职工那样有“双重”机会。
三、特殊情况说明
虽然一般情况下夫妻双方不能分别休探亲假，但在某些特殊情况下，如夫妻双方因工作原因长期分居两地，且均符合探亲假的条件（如工作性质、工作时间、居住情况等），那么双方都有可能享受到探亲假。然而，这种情况需要具体根据单位的规定和实际情况来判断。
综上所述，探亲假一年内夫妻双方一般不可以不同时间休。这是基于政策规定、实际操作中的考虑以及公平性原则所得出的结论。如果夫妻双方有特殊情况需要分别休探亲假，建议提前与单位沟通并了解相关规定。