针对“员工卖自用办公用品给公司怎么处理”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、行为性质分析
一般情况：员工将自己的自用办公用品卖给公司，如果这是基于公平交易的原则，且没有利用职务之便进行不正当操作，那么这通常被视为正常的买卖行为。
特殊情况：然而，如果员工利用职务上的便利，如掌握公司采购信息、定价权等，以低价买入或高价卖出的方式与公司进行交易，从而谋取私利，那么这种行为就可能构成职务侵占或不当得利，甚至可能触犯刑法。
二、税务处理
增值税：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则的规定，自然人销售自己使用过的物品是免征增值税的。但这里需要明确的是，该规定适用于“其他个人”，即非企业主体的自然人。员工作为公司的成员，在将自用办公用品卖给公司时，是否适用这一免税规定，还需根据具体情况和当地税务部门的规定来确定。
所得税：对于员工因出售自用办公用品而获得的收入，是否需要缴纳个人所得税，也需要根据具体的税收政策和规定来判断。一般来说，如果这笔收入构成了员工的额外收入，且达到了纳税标准，那么员工是需要依法缴纳个人所得税的。
三、公司内部处理建议
制定明确政策：公司应制定明确的内部政策，规定员工与公司之间的交易行为，特别是关于自用办公用品的买卖。政策应明确交易的公平性、透明度以及相关的税务和财务处理。
加强监管：公司应加强对员工与公司之间交易行为的监管，确保交易的合法性和合规性。可以通过设立专门的监督机构或指定专人负责此类事务的审核和监督。
教育培训：公司应定期对员工进行法律法规和职业道德的培训，提高员工的法律意识和职业道德水平。让员工明确知道哪些行为是合法的，哪些行为是违法的，以及违法行为的后果。
四、结论
员工卖自用办公用品给公司这一行为，需要根据具体情况来判断其性质和处理方式。如果是基于公平交易的原则进行的正常买卖行为，那么按照正常的税务和财务规定处理即可；但如果存在职务侵占或不当得利等违法行为，那么公司应依法追究员工的责任，并采取相应的法律措施来维护公司的合法权益。同时，公司也应加强内部管理和监管，制定明确的政策和规定来规范员工与公司之间的交易行为。