如公司错误地认为员工违法，员工有权通过法律途径维护自己的合法权益。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 明确公司的指控

1. 详细询问：员工应首先与公司沟通，明确公司指控的具体违法行为是什么，是否有相关的证据支持。
2. 证据审查：员工应自我审查，确认自己是否确实存在公司所指控的违法行为。

二. 法律途径维权

1. 内部申诉：如果员工确认自己没有违法，可以向公司的人力资源部门或上级管理层提出申诉，要求公司进行调查并给出合理解释。
2. 外部援助：如果公司内部申诉无果，员工可以寻求外部法律援助，如向当地劳动监察部门投诉，或者委托律师提起劳动争议仲裁或诉讼。

三. 法律保障

1. 根据《中华人民共和国劳动法》第三条：劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利、接受职业技能培训的权利、享受社会保险和福利的权利、提请劳动争议处理的权利以及法律规定的其他劳动权利。这意味着员工在面临公司无端指控时，有权通过法律途径维护自己的合法权益。
2. 证据重要性：在维权过程中，员工应尽可能收集并保留与公司指控相关的所有证据，如工作记录、沟通记录、证人证言等，以证明自己的清白。

四. 后续建议

1. 保持冷静：面对公司的指控，员工应保持冷静，理性分析，避免情绪化处理。
2. 积极维权：如果确认自己没有违法，员工应勇敢地站出来维护自己的合法权益，不要害怕或逃避。
3. 法律咨询：在维权过程中，员工可以咨询专业律师，获取更具体的法律建议和支持。

综上所述，如果公司错误地认为员工违法，员工应通过内部申诉和外部援助等法律途径来维护自己的合法权益。同时，员工应保留相关证据，以证明自己的清白。如有进一步需要，您可以继续咨询我。