如果工程验收不通过且业主签字拒绝赔偿，可以通过法律途径来维护自身的合法权益。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析和应对：
一. 明确验收不通过的原因及责任归属
查验合同条款：首先，需要仔细查验工程合同中关于验收标准、验收流程以及验收不通过的责任归属等条款。这有助于明确双方的权利和义务，为后续的法律行动提供依据。
分析验收报告：详细分析验收报告，找出导致验收不通过的具体原因。这些原因可能涉及工程质量、规格不符、延期完成等方面。
确定责任方：根据合同条款和验收报告，确定导致验收不通过的责任方。如果确实是业主方的问题（如无理拒绝验收或故意拖延），则为后续的法律诉讼打下坚实基础。
二. 依据法律法规采取法律行动
发送律师函：在明确责任后，可以先通过发送律师函的方式，正式向业主提出索赔要求，并明确告知其法律后果。这既是一种法律手段，也是一种沟通方式，有助于促使双方通过协商解决问题。
提起诉讼：如果律师函未能解决问题，且业主仍然拒绝赔偿，那么可以依据《中华人民共和国合同法》等相关法律法规，向人民法院提起诉讼。根据《合同法》第一百零七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。在诉讼过程中，需要准备充分的证据材料，包括合同文本、验收报告、双方沟通记录等，以证明自己的主张。
三. 注意保留证据并寻求专业支持
保留证据：在整个过程中，务必注意保留所有与工程验收、双方沟通以及后续法律行动相关的证据材料。这些证据将在法律诉讼中发挥关键作用。
寻求专业支持：如果可能的话，可以寻求其他专业人士（如建筑师、工程师等）的支持和协助。他们可以提供专业意见和证据支持，有助于增强诉讼的说服力。
我建议，在采取任何法律行动之前，先尝试与业主进行友好协商。如果协商无果，再考虑通过法律途径来维护自身权益。同时，务必确保自己的行动符合法律法规的要求，以免引发不必要的法律纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。