当原告的事实与理由与证据不符时，被告在诉讼中可以采取一系列策略来应对。以下是对此问题的全面分析：

1. 明确以实际事实为准：

   • 在诉讼中，法院将依据实际发生的事实来作出判决。因此，如果原告起诉书中的内容与事实不符，被告应坚持以实际事实为依据进行辩护。

2. 提出反驳证据：

   • 被告可以积极收集并提交反驳证据，以证明原告的主张与事实不符。这些反驳证据可以包括书证、物证、证人证言等，用以揭示原告证据中的漏洞或不合理之处。

3. 详细阐述事实与观点：

   • 在庭审过程中，被告应清晰、有条理地阐述实际发生的情况，并结合自己收集的证据来支撑观点。通过逻辑严密的陈述，使法官对原告的主张产生疑虑，进而采纳被告的观点。

4. 申请法院调查取证：

   • 如果被告认为原告提交的证据存在伪造、篡改等情形，或者原告拒绝提供关键证据，被告可以向法院申请调查取证。法院将根据申请，依法进行调查并获取客观证据，以还原事实真相。

5. 指出原告证据的问题：

   • 在质证环节，被告应针对原告提交的证据，从真实性、关联性、合法性三个方面进行全面质疑。指出证据中的矛盾、不合理之处，以及无法证明原告主张的事实。

6. 请求损害赔偿：

   • 如果原告的主张与事实不符，且给被告造成了经济损失或名誉损害，被告可以在诉讼中提出损害赔偿请求。法院将根据实际情况，依法判决原告承担相应的赔偿责任。

7. 保持冷静与理性：

   • 面对原告的不实主张，被告应保持冷静与理性，避免情绪化的反应。通过合法途径维护自身权益，避免采取过激行为或发表不当言论，以免影响诉讼结果。

综上所述，当原告的事实与理由与证据不符时，被告应坚持以实际事实为依据，积极收集并提交反驳证据，详细阐述事实与观点，申请法院调查取证（如必要），指出原告证据的问题，并在必要时请求损害赔偿。同时，保持冷静与理性，通过合法途径维护自身权益。