小额担保公司收取担保金在一定条件下是合法的。其合法性主要取决于以下几个方面：

1. 明确的合同约定：

   • 小额担保公司与被担保人必须在合同中明确约定收取担保金的相关事宜，包括金额、退还条件等。
   • 该约定不得违反法律法规的强制性规定。只要合同内容合法且双方自愿达成，该约定即具有法律效力。

2. 符合法律依据：

   • 在特定行业或地区，法律法规可能直接规定了担保公司可以收取担保金的情况和条件。
   • 小额担保公司的经营活动必须处于相关监管部门的有效监管之下，且收取担保金的行为需符合监管规定。

3. 合理性与公平性：

   • 收取的担保金金额应合理，避免对被担保人造成过大的负担。
   • 收取方式也应公平、公正，确保双方的权益得到平衡保护。

然而，也存在不合法的情形。例如，如果小额担保公司无约定擅自收取担保金，或者收取的担保金金额过高、使用不当、不退还等，这些都可能构成违法行为。

因此，在实际操作中，建议小额担保公司和被担保人仔细审查合同条款，确保双方权益得到妥善保护。如果对小额担保公司收取担保金的合法性存在疑问，或者因此产生纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议，帮助你通过合法途径维护自己的权益。