国企代上级部门支付费用是否违法，需根据具体情况分析。以下是对此问题的详细分析：

一. 一般情况下的代支付行为

1. 法律未明确禁止：在我国现行法律体系中，并未明确禁止国企代上级部门支付费用的行为。因此，从法律条文的角度来看，这种行为并不直接构成违法。
2. 需遵守相关规定：虽然法律未明确禁止，但国企在代支付费用时，必须严格遵守国家财经纪律和财务管理制度，确保资金的合法、合规使用。

二. 特殊情况下的代支付行为

1. 涉及挪用公款等违法行为：如果国企代上级部门支付的费用来源不当，如挪用公款或其他非法资金，那么这种行为将构成违法。此时，不仅国企需要承担法律责任，相关责任人员也可能面临刑事追究。
2. 违反合同约定或内部规定：如果国企与上级部门之间存在明确的合同约定或内部规定，禁止代支付行为，那么国企擅自代支付将构成违约或违反内部规定，虽然不一定构成违法，但可能需要承担相应的民事责任或内部纪律处分。

三. 我的观点

• 国企代上级部门支付费用本身并不直接构成违法，但必须在法律允许的范围内进行，并严格遵守相关财务管理制度。
• 在实际操作中，国企应谨慎对待代支付行为，确保资金来源的合法性，并避免违反合同约定或内部规定。
• 如有必要，国企应咨询专业法律机构或财务顾问，以确保代支付行为的合法性和合规性。

综上所述，国企代上级部门支付费用是否违法，需根据具体情况判断。我建议国企在代支付前，应充分了解相关法律法规和财务管理制度，确保行为的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。