孕妇在单位发生工伤时，赔偿流程与一般工伤相似，但需注意保障孕妇的特殊权益。以下是详细的解答：
一、赔偿项目
医疗费用：
- 符合工伤保险诊疗项目目录、药品目录、住院服务标准的医疗费用，从工伤保险基金支付。
- 包括治疗工伤所需的挂号费、诊疗费、住院费、医疗费、药费、就医路费全额报销。
停工留薪期工资：
- 孕妇因工伤需要暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
伤残津贴：
- 如果孕妇因工伤导致残疾，根据伤残等级，由工伤保险基金按月支付伤残津贴。
一次性伤残补助金：
- 根据伤残等级，孕妇可以获得一次性伤残补助金，标准由工伤保险基金支付。
一次性伤残就业补助金和一次性工伤医疗补助金：
- 劳动关系解除或终止时，根据省级政府规定，孕妇可以获得一次性伤残就业补助金和一次性工伤医疗补助金。
护理费：
- 如果孕妇因工伤需要护理，根据护理等级和实际需要，可以获得相应的护理费。
二、工伤认定及赔偿流程
申请工伤认定：
- 用人单位应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 如用人单位未按规定时间申请，孕妇或其近亲属、工会组织可在1年内直接提出工伤认定申请。
提交材料：
- 申请工伤认定时，需提交工伤认定申请表、劳动关系证明材料（如劳动合同）、医疗机构诊断证明或职业病诊断证明书等。
审核与认定：
- 社会保险行政部门受理后，会对申请人提供的证据进行调查核实。
- 一般自受理申请之日起60日内作出工伤认定决定，对于事实清楚、权利义务明确的工伤认定申请，应当在15日内作出认定决定。
劳动能力鉴定：
- 经治疗伤情相对稳定后，如果孕妇存在残疾、影响劳动能力，应进行劳动能力鉴定。
确定赔偿项目和标准：
- 根据伤残等级和实际情况，确定具体的赔偿项目和标准。
协商赔偿：
- 与用人单位协商赔偿事宜，如果协商不成，可以通过劳动仲裁、诉讼等方式解决争议。
三、特别注意事项
- 保障孕妇权益：在工伤处理过程中，单位应特别保障孕妇的合法权益，不得因其怀孕而歧视或降低待遇。
- 未参保责任：如果单位未依法参加工伤保险，那么全部赔偿责任将由单位承担。
综上所述，孕妇在单位发生工伤时，应及时申请工伤认定，并按照规定的流程进行赔偿。单位应依法履行赔偿责任，保障孕妇的合法权益。如果协商不成或遇到其他问题，可以通过法律途径解决争议。