公证员不执行上级命令是否违法，需要具体情况具体分析。

1. 一般情况下不违法：

   • 公证员作为专业的法律职业者，在执行职务时应当遵循法律、法规和职业道德规范，而不是简单地执行上级命令。
   • 如果上级命令与法律、法规或职业道德规范相冲突，公证员有权且应当拒绝执行，并向上级说明理由。
   • 在这种情况下，公证员不执行上级命令并不构成违法，反而是对法律、法规和职业道德规范的尊重和维护。

2. 特殊情况下可能违法：

   • 如果公证员无正当理由拒绝执行上级的合法命令，且该命令并不违反法律、法规或职业道德规范，那么公证员的行为可能构成对职业纪律的违反，甚至可能构成违法。
   • 但这种情况下，需要具体分析命令的合法性、合理性以及公证员拒绝执行的理由和依据。

综上所述，公证员不执行上级命令是否违法，并不能一概而论。关键在于分析上级命令的合法性、合理性以及公证员拒绝执行的理由和依据。如果你在这方面有具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。