如果合同约定适用合同法但其已失效，确实可以适用民法典。下面我来详细解释一下这个问题：

首先，我们需要明确的是，《合同法》已经于2021年1月1日被《民法典》所取代，也就是说，《合同法》已经失效，不再具有法律效力。因此，如果合同中明确约定适用《合同法》，那么这一约定在《合同法》失效后就无法再执行了。

接下来，我们来看《民法典》的相关规定。《民法典》作为一部综合性的民事法律，它涵盖了包括合同在内的多个民事法律关系。在《民法典》中，关于合同的规定被整合到了“合同编”中，对合同的订立、效力、履行、保全、变更和转让、权利义务终止以及违约责任等方面都进行了详细的规定。

因此，当合同约定适用的《合同法》失效后，我们自然应该转向《民法典》来寻找相关的法律依据。在《民法典》的框架下，我们可以根据合同的具体内容和情况，找到相应的法律条款来维护自己的权益或者解决纠纷。

综上所述，如果合同约定适用《合同法》但其已失效，我们完全可以适用《民法典》来处理相关的合同问题。如果你在这方面有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。