医院合同工遣散时是有工资的。具体来说：
合同工因个人原因离职：
- 如果合同工因个人原因主动辞职，并且按照医院的规定和劳动合同的约定提前通知了医院，那么医院应当按照合同约定支付其应得的工资，但通常没有经济补偿。
医院主动解除合同：
- 若医院因合同工存在严重违反医院规章制度、严重失职等情形而辞退合同工，根据《劳动合同法》的相关规定，医院无需支付经济补偿，但仍需支付合同工已工作期间的工资。
- 若医院因经营困难、经济性裁员等合法原因辞退合同工，或者合同工因患病、非因工负伤等原因不能继续工作，医院提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资后解除合同，那么医院不仅需要支付合同工已工作期间的工资，还需要按照劳动合同法的规定支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
医院违法解除合同：
- 如果医院无正当理由辞退合同工，属于违法解除劳动合同，那么医院不仅需要支付合同工已工作期间的工资，还需要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
综上所述，医院合同工遣散时是否有工资，以及是否有经济补偿或赔偿金，取决于具体的离职原因和劳动合同法的相关规定。如果合同工对遣散时的工资支付或经济补偿有疑问，可以与医院协商，协商不成可以申请劳动仲裁维权。