药企要求查乙肝两对半是否合法，需根据具体情况分析。

一. 一般情况

1. 法律原则：根据《中华人民共和国就业促进法》以及《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位在招聘过程中，应当遵循公平、公正的原则，不得对求职者进行与岗位无关的健康检查，尤其是不得进行乙肝等传染病项目的检测，除非该岗位确实存在特殊的健康要求。

2. 乙肝两对半检测的性质：乙肝两对半检测是针对乙型肝炎病毒的一种专项检查，用于判断个体是否感染或曾经感染过乙肝病毒。这种检测通常与特定的职业健康要求相关，如食品、医疗等行业。

3. 药企的特殊情况：药企作为特殊行业，其部分岗位可能确实存在对乙肝等传染病的特殊要求，尤其是那些直接涉及药品生产、质量控制等关键环节的岗位。然而，这并不意味着所有药企岗位都可以随意进行乙肝两对半检测。

二. 合法情况

• 如果药企的某个岗位确实存在对乙肝等传染病的特殊要求，且这种要求是基于岗位性质、工作环境以及员工健康保护等因素的合理考量，那么药企在该岗位招聘时进行乙肝两对半检测是合法的。

三. 非法情况

• 如果药企在没有合理依据的情况下，对所有求职者或员工一律进行乙肝两对半检测，或者将检测结果作为录用、晋升、辞退等决定的唯一或主要依据，那么这种行为就违反了相关法律法规，属于非法行为。

我建议：药企在招聘或管理过程中，应严格遵守相关法律法规，不得随意进行与岗位无关的健康检查。如需进行特殊健康检查，应事先明确岗位的健康要求，并确保检查行为的合法性和合理性。同时，求职者也应了解自己的合法权益，对于非法的健康检查要求，可以依法拒绝并寻求法律援助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。