机关单位申报人在申报社保时，应承担以下主要责任：

1. 确保申报信息的真实性和准确性：申报人需如实提供参保人员的个人信息、缴费基数、缴费时间等关键数据，确保所有申报信息准确无误。这是申报人的基本责任，也是社保制度得以有效运行的前提。

2. 按时足额缴纳社保费用：机关单位作为缴费单位，有义务按照规定的缴费比例和缴费时间，及时足额地缴纳社会保险费用。这既是保障员工社保权益的需要，也是履行单位社会责任的体现。

3. 遵守社保相关法律法规：申报人在申报社保过程中，必须严格遵守国家及地方关于社会保险的法律法规，不得存在任何违法违规行为，如虚报、瞒报、漏报等。

4. 配合社保部门的监督和检查：社保部门有权对机关单位的社保申报情况进行监督和检查。申报人应积极配合，提供必要的文件和资料，如实反映情况，不得拒绝或阻挠。

5. 及时更新和维护社保信息：随着参保人员个人情况的变化，如职位变动、薪资调整等，申报人需及时更新和维护相关社保信息，确保信息的时效性和准确性。

综上所述，机关单位申报人在申报社保时，应切实履行好上述责任，确保社保制度的顺利运行和参保人员的合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。