关于“由于员工侵占导致客户损失谁来赔偿”的问题，结论需根据具体情况而定，以下是从不同角度进行的分析：
员工个人承担责任：
- 若员工的行为属于个人行为，且明显超出职务范围，客户没有合理理由相信其代表单位，那么员工个人应自行承担损失赔偿责任。客户可以通过刑事附带民事诉讼或另行提起民事诉讼要求员工赔偿。
单位承担补充责任：
- 若员工的行为属于职务行为范畴，或者单位在内部管理上存在过错（如监管不力、未及时察觉员工异常行为等），导致员工有机会实施侵占行为，那么单位可能需要承担一定的民事赔偿责任。单位在承担责任后，可以依据内部规定向有故意或重大过失的员工追偿。
综合判断：
- 在实践中，需要综合判断员工的行为性质、与职务的关联程度、客户是否善意等因素，来确定具体的责任承担主体。若协商赔偿不成，客户可以起诉公司和涉事员工。
综上所述，由于员工侵占导致客户损失的赔偿责任，需要根据具体情况来判断是由员工个人承担还是由单位承担补充责任，或者两者共同承担。如果您或您的企业遇到了类似的问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。