计时工资和甲方依法制定的工资分配制度的主要区别在于它们的定义、确定方式以及应用场景。

1. 定义与性质：

   • 计时工资：计时工资是按照劳动者的工作时间来计算工资的一种方式，通常根据小时、日、周或月等时间单位来计量，并支付相应的工资报酬。它主要反映的是劳动者在特定时间内的劳动投入。
   • 甲方依法制定的工资分配制度：这是指企业（甲方）根据相关法律法规，结合自身经营情况和劳动者的工作性质、岗位等因素，制定的一套关于工资分配的制度。这个制度不仅包括了工资的计算方法，还可能涉及工资的构成、发放时间、奖金、津贴、福利等多个方面。

2. 确定方式：

   • 计时工资的确定相对简单，主要依据劳动者的工作时间和单位时间的工资标准来计算。
   • 甲方依法制定的工资分配制度则更为复杂，需要综合考虑企业的经济状况、劳动者的岗位价值、市场薪资水平、法律法规要求等多个因素，并通过一定的程序（如职工代表大会讨论、与劳动者协商等）来确定。

3. 应用场景：

   • 计时工资多用于那些可以明确计量工作时间的岗位，如生产线工人、计时工等。
   • 甲方依法制定的工资分配制度则适用于整个企业，对所有员工的工资分配进行统一规范和管理。

综上所述，计时工资和甲方依法制定的工资分配制度在定义、确定方式以及应用场景上存在明显的区别。计时工资更侧重于对劳动者工作时间的直接计量和报酬支付，而甲方依法制定的工资分配制度则是一个更为全面、系统的工资管理框架，旨在确保企业工资的合理性和公平性。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的咨询，请直接向我提问。