关于“公司未明确告知法律后果且未履行法定程序的情况下离职申请书是否有效”的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
结论前置
在一般情况下，即使公司未明确告知法律后果且未履行法定程序，员工的离职申请书仍然可能被视为有效，但具体效力需根据实际情况，特别是离职申请书的内容、提交方式、公司是否接受以及双方后续行为等因素综合判断。
详细分析
离职申请书的本质：
- 离职申请书是员工向公司表达离职意愿的书面文件，其核心在于员工的离职意愿是否真实、明确。
- 法律并未规定离职申请书必须包含特定的法律后果告知或必须履行特定的法定程序才有效。
公司告知法律后果的义务：
- 虽然公司通常有义务向员工说明离职可能涉及的法律后果（如经济补偿、社保关系转移等），但这并非离职申请书有效的必要条件。
- 公司未告知法律后果，可能影响员工的决策，但并不直接决定离职申请书的效力。
法定程序与离职申请书的关系：
- 法定程序通常指的是公司处理员工离职时应遵循的法律规定，如提前通知期、经济补偿计算等。
- 这些程序更多地关乎公司离职管理的合规性，而非离职申请书本身的有效性。
实际情况的考量：
- 如果离职申请书内容明确、提交方式合规，且公司实际上已经接受（如办理离职手续、停发工资等），则离职申请书通常被视为有效。
- 如果双方对离职申请书存在争议，或公司未明确回应，则可能需要通过劳动仲裁或诉讼等方式来确定其效力。
法律建议
- 在提交离职申请书前，建议员工尽量了解离职可能涉及的法律后果，并与公司沟通确认离职事宜。
- 如果公司未履行法定程序或存在其他违规行为，员工可以依法维护自己的权益，包括向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 在处理离职纠纷时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
综上所述，公司未明确告知法律后果且未履行法定程序的情况下，离职申请书仍然可能有效，但具体效力需根据实际情况综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。