如果公司使用了员工名字的同音字，并且因此产生了劳动纠纷，申请劳动仲裁是有用的。以下是对这一问题的详细分析：

劳动仲裁的适用性

劳动仲裁是解决劳动纠纷的一种法定程序，适用于用人单位与劳动者之间因劳动关系发生的争议。当公司使用员工名字的同音字导致员工权益受损，如工资发放错误、社保缴纳问题、劳动合同履行不当等，这些都属于劳动纠纷的范畴，员工有权向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁。

劳动仲裁的具体流程

1. 提交仲裁申请：员工需要准备相关证据材料，如劳动合同、工资单、社保缴纳记录等，并向劳动仲裁委员会提交仲裁申请。
2. 受理与审查：劳动仲裁委员会在收到申请后，会进行受理与审查，确认申请是否符合仲裁条件。
3. 开庭仲裁：如果申请符合仲裁条件，劳动仲裁委员会会安排开庭仲裁，双方可以在仲裁庭上进行陈述和辩论。
4. 仲裁裁决：仲裁庭在听取双方陈述和辩论后，会作出仲裁裁决，该裁决对双方具有法律约束力。

需要注意的问题

1. 证据收集：在提起劳动仲裁前，员工需要尽可能收集相关证据，以证明公司使用了自己名字的同音字并导致了劳动纠纷。
2. 仲裁时效：劳动仲裁有一定的时效限制，员工需要在规定的时间内提起仲裁申请，否则可能会丧失仲裁权利。
3. 裁决执行：如果公司不履行仲裁裁决，员工可以向法院申请强制执行，以确保自己的权益得到保障。

综上所述，如果公司使用了员工名字的同音字并因此产生了劳动纠纷，员工完全有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，员工需要准备好相关证据材料，并按照仲裁流程进行操作。