老板给小三发工资是否违法，取决于具体情况。以下是对此问题的详细分析：
若老板与小三存在真实的劳动关系：
- 如果老板的小三确实在公司有正当的职位，并且提供了相应的劳动或服务，那么老板给她发工资是合法的。这种情况下，劳动关系的存在是基于工作和服务，与个人的情感关系无关。
若老板与小三不存在真实的劳动关系：
- 如果老板与小三之间并没有真实的劳动关系，即小三并未在公司提供任何劳动或服务，但老板仍然以工资的名义给她支付款项，这可能涉及到不正当的财务往来或利益输送。在这种情况下，虽然发工资的行为本身不一定直接违法，但它可能掩盖了其他违法行为，如偷税漏税、挪用公司资金等。
- 此外，如果老板使用公司资金给小三发工资，且该行为未经公司其他股东或董事的同意，那么这可能构成对公司财产的非法处置或侵占，从而触犯法律。
道德和伦理考量：
- 即便老板给小三发工资在法律上可能不构成直接违法，但这种行为在道德和伦理上往往是不被接受的。它可能损害公司的声誉，破坏员工之间的信任，甚至对公司的正常运营造成负面影响。
综上所述，老板给小三发工资是否违法取决于具体情况。如果双方存在真实的劳动关系，那么发工资是合法的；如果不存在真实的劳动关系，那么这种行为可能涉及不正当的财务往来或利益输送，甚至可能触犯法律。在任何情况下，这种行为都应谨慎对待，并考虑其可能带来的法律、道德和伦理风险。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。