不会超出诉讼请求。具体分析如下：
在民事诉讼中，法院的任务之一是查明案件事实，并根据查明的事实作出相应的判决。如果原告主张的是民间借贷关系，但法院在审理过程中发现实际法律关系为委托合同纠纷，并据此作出判决，这一行为并不构成超出诉讼请求。
诉讼请求与审理范围：原告的诉讼请求是其希望法院作出的判决或裁定，但法院的审理范围并不完全受限于原告的诉讼请求表述。法院需根据案件事实和法律规定，对案件进行全面审理，以查明案件的真实法律关系。
法律关系的认定：在审理过程中，法院有权根据当事人提供的证据和查明的事实，对案件涉及的法律关系进行认定。如果法院认定的法律关系与原告主张的不一致，法院有权根据查明的法律关系作出相应的判决。
判决与诉讼请求的关系：虽然法院的判决应当针对原告的诉讼请求作出，但判决的内容并不完全受限于诉讼请求的表述。只要判决的内容是基于案件事实和法律规定，且没有超出原告的诉讼请求范围（即没有判决原告未主张的内容），就不构成超出诉讼请求。
法律后果：如果原告对法院的判决不服，认为法院认定的法律关系有误或判决超出了诉讼请求范围，原告有权依法提起上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。
综上所述，原告主张民间借贷而法院查明事实认为是委托合同纠纷并判决，并不构成超出诉讼请求。法院的判决是基于案件事实和法律规定作出的，原告如果不服可以依法提起上诉或申请再审。