关于您提出的“轻伤二级双方达成协议，检察院酌情处理不予起诉，为何公安机关开不出来无犯罪证明”的问题，我为您详细解答如下：
结论前置：
尽管双方已达成协议且检察院酌情处理不予起诉，但在某些情况下，公安机关可能仍然无法开具无犯罪证明。这主要是因为“无犯罪证明”的开具通常基于公安机关的犯罪记录系统，而该系统可能记录了您的相关案件信息，即使最终未起诉或判决。
详细分析：
检察院不予起诉的含义：
- 检察院的不予起诉决定，是基于对案件的审查后认为没有起诉的必要或者证据不足等法定情形而作出的。这并不意味着案件没有发生过，也不意味着当事人在法律上完全无罪。
公安机关犯罪记录系统的记录原则：
- 公安机关的犯罪记录系统通常记录所有涉及刑事案件的当事人信息，包括被立案侦查、被采取强制措施、被起诉等各个阶段的案件信息。即使案件最终未被起诉或判决，这些信息仍可能保留在系统中。
无犯罪证明的开具条件：
- 无犯罪证明是公安机关根据犯罪记录系统出具的一种证明文件，用于证明当事人在一定期限内没有犯罪记录。由于犯罪记录系统可能包含所有案件信息，因此即使检察院不予起诉，公安机关也可能因为系统中存在相关记录而无法开具无犯罪证明。
可能的解决方案：
- 如果您确实需要无犯罪证明，可以尝试向公安机关申请查询并更正犯罪记录系统中的信息。您需要提供相关证据材料，如检察院的不予起诉决定书、双方的和解协议等，以证明您的案件已经得到妥善处理且您没有犯罪记录。
- 另外，您也可以咨询当地公安机关或法律专业人士，了解具体的开具无犯罪证明的程序和要求，以便更好地准备相关材料和证据。
综上所述，尽管检察院酌情处理不予起诉，但由于公安机关犯罪记录系统的记录原则和开具无犯罪证明的条件限制，您可能仍然无法直接获得无犯罪证明。建议您根据具体情况采取相应的解决方案，并咨询当地公安机关或法律专业人士以获取更准确的指导和帮助。