公司把员工扣在门卫室是违法的。

从法律角度来看，公司无权非法限制员工的人身自由。将员工扣在门卫室，实际上是对员工人身自由的一种限制，这种行为侵犯了员工的合法权益。

具体来说，根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工享有自由择业、自由离职以及在工作过程中的人身自由等权利。公司或用人单位应当尊重并保护员工的这些权利，而不得以任何形式进行侵犯。

如果公司确实存在将员工扣在门卫室的情况，员工可以首先与公司进行沟通，要求公司立即停止这种违法行为，并恢复员工的人身自由。如果公司拒绝改正，员工可以向当地的劳动监察部门或公安机关进行投诉或报案，以维护自己的合法权益。

总之，公司把员工扣在门卫室是违法的，员工有权要求公司立即停止这种行为，并可以通过法律途径来维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。