在处理老板行贿官员，但双方供述金额不一致的情况时，纪委通常会采取一系列细致且严谨的调查措施来确保事实的真相得以查清。以下是我根据多年的法律实务经验，为你详细梳理的纪委可能的处理步骤：

1. 深入调查与核实：

   • 纪委首先会对双方的供述进行详细的记录和分析，对比其中的差异点。
   • 通过查阅相关财务记录、银行流水、交易凭证等客观证据，来验证双方供述的真实性。
   • 可能会对相关证人进行询问，以获取更多关于行贿行为的信息和证据。

2. 综合运用调查手段：

   • 纪委可能会运用技术侦查手段，如监控录像、通话录音等，来还原行贿行为的具体过程。
   • 对涉案人员进行审讯，通过心理战术和询问技巧，进一步挖掘案件真相。
   • 如有必要，纪委还会协调其他相关部门，如公安机关、检察机关等，进行联合调查。

3. 严格依法依规处理：

   • 在查清事实的基础上，纪委会根据相关法律法规和党纪条规，对涉案人员作出相应的处理。
   • 对于行贿和受贿行为，都会依法追究法律责任，不论金额大小。
   • 同时，纪委还会关注案件背后的深层次原因，如制度漏洞、监管不力等，并提出相应的整改建议。

4. 保障程序公正：

   • 在整个调查过程中，纪委都会严格遵守法定程序，确保当事人的合法权益得到保障。
   • 当事人有权申请听证、提出申辩等，纪委也会充分听取并认真考虑当事人的意见。

综上所述，当老板行贿官员且双方供述金额不一致时，纪委会通过深入调查、综合运用调查手段、严格依法依规处理以及保障程序公正等步骤来查清事实真相，并依法作出相应处理。如果你对此类法律问题有更多疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。