医药连锁企业用第三方人员来代替本企业执业药师审核处方是不合法的。

一. 法律依据

1. 《药品管理法》规定：药品经营企业必须配备足够的、符合规定的执业药师，以确保药品质量和药学服务的专业性。执业药师需对处方进行审核，确保用药安全、有效。

2. 《执业药师注册管理办法》明确：执业药师需注册在药品生产、经营、使用单位，并按照注册的执业范围、执业类别、执业地点从事相应的执业活动。第三方人员未注册在本企业，无权代替本企业执业药师审核处方。

二. 法理分析

1. 执业药师的专业性：执业药师经过专业培训和考试，具备丰富的药学知识和临床经验，能够准确审核处方，确保患者用药安全。第三方人员可能缺乏这种专业性和经验，无法替代执业药师的工作。

2. 法律责任的明确性：药品经营企业需对药品质量和药学服务负责。若使用第三方人员代替执业药师审核处方，一旦出现问题，企业将面临严重的法律责任。

三. 实际案例

• 例如，某医药连锁企业因使用第三方人员代替执业药师审核处方，导致患者用药不当，出现不良反应。最终，该企业被监管部门查处，并承担了相应的法律责任。

综上所述，医药连锁企业不能用第三方人员来代替本企业执业药师审核处方。这是为了确保药品质量和药学服务的专业性，以及保护患者的用药安全。我建议企业应严格遵守相关法律法规，配备足够的执业药师，并确保其按照规定的执业范围从事活动。如有进一步需要，您可以继续咨询我。