单位不交社保，劳动者自行补缴后，是可以申请劳动仲裁的。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国社会保险法》明确规定，用人单位应当按时足额缴纳社会保险费，这是其法定义务。若用人单位未依法缴纳，劳动者有权要求补缴，并在必要时寻求法律救济。
2. 《中华人民共和国劳动合同法》也指出，用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费的，劳动者可以解除劳动合同，并有权要求用人单位支付经济补偿。
3. 《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》则明确将因社会保险发生的争议纳入劳动争议范畴，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

二、补缴社保与劳动仲裁的关系

补缴社保属于劳动仲裁的受案范围，但具体处理方式可能因地区而异。部分地区的劳动仲裁机构或法院可能认为社保补缴争议属于行政管理范畴，应通过劳动监察或社保经办机构等行政途径解决。然而，这并不影响劳动者在必要时通过劳动仲裁来维护自己的权益。

三、劳动仲裁的准备与程序

1. 证据收集：劳动者在提起仲裁前，应准备充分的证据，如劳动合同、工资条、社保缴纳记录等，以证明与用人单位的劳动关系及单位未履行社保缴纳义务的事实。
2. 提交申请：劳动者需向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。
3. 仲裁流程：劳动争议仲裁委员会在收到申请后，将依法进行立案、开庭和审理。劳动者需积极配合，提供必要的证据和陈述。
4. 裁决结果：若仲裁庭裁定用人单位存在未按时足额缴纳社保的行为，将依法要求用人单位限期补缴，并可能对其处以相应的法律处罚。

四、其他注意事项

1. 时效问题：劳动者在申请仲裁时，应注意仲裁时效的限制。通常，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。
2. 地区差异：由于不同地区的法律法规和具体操作流程可能存在差异，劳动者在申请仲裁前应咨询当地的劳动保障部门或专业律师，以了解具体的法律规定和操作流程。

综上所述，单位不交社保时，劳动者自行补缴后有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在维权过程中，劳动者应充分了解相关法律法规和政策规定，积极准备证据材料，并选择合适的维权手段来捍卫自己的社保权益。