因正当防卫被羁押后，若最终被判定无罪，是可以申请国家赔偿的。下面我为您详细解释这一结论：

法律依据与解释

根据《国家赔偿法》的相关规定，当行使侦查、检察、审判职权的机关以及看守所、监狱管理机关及其工作人员在履行职责过程中，违反刑事诉讼法对公民采取拘留措施，或者虽依照法定条件和程序采取拘留措施，但拘留时间超出刑事诉讼法规定的时限，随后决定撤销案件、不起诉或者判决宣告无罪并终止追究刑事责任的，受害人依法享有取得赔偿的权利。

这意味着，如果您因正当防卫而被错误羁押，并最终被判定无罪，您有权向赔偿义务机关提出国家赔偿申请，要求对您在被错误羁押期间人身自由受到限制等方面的损害进行赔偿。

申请流程与注意事项

1. 确认赔偿义务机关：通常，赔偿义务机关是作出错误羁押决定的机关。
2. 准备申请材料：包括您的身份证明、羁押决定书、无罪判决书等相关法律文件。
3. 提交赔偿申请：向赔偿义务机关提交书面赔偿申请，并附上相关证据材料。
4. 等待审查与处理：赔偿义务机关将依法对您的申请进行审查，并作出是否赔偿的决定。

在申请过程中，建议您保持与赔偿义务机关的沟通，及时了解申请进展，并准备充分的证据材料以支持您的赔偿请求。

特殊情况说明

虽然大多数情况下，因正当防卫被羁押后判无罪是可以申请国家赔偿的，但也存在一些特殊情况。例如，如果羁押决定是基于当时掌握的证据和法律规定作出的，且并未超出法律规定的时限，那么即使最终被判定无罪，也可能不属于国家赔偿的范围。因此，在具体申请时，还需要结合您的实际情况进行具体分析。

综上所述，因正当防卫被羁押后判无罪，您是有权申请国家赔偿的。在申请过程中，建议您咨询专业律师以获取更详细的法律指导和帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。