套牌被查配合调查期间一般不算拘留时间。下面我详细为你解释一下：

首先，我们要明确“套牌被查配合调查”和“拘留”是两个不同的法律概念。套牌被查时，你可能会被要求配合警方的调查，这通常是为了收集证据、了解案情等目的。而拘留，则是一种强制性的法律措施，通常是在有充分证据表明你涉嫌犯罪，且为了防止你逃避法律责任、妨碍诉讼等而采取的。

在配合调查期间，你虽然可能会受到一些限制，比如不能随意离开指定地点等，但这并不等同于拘留。拘留是有明确的法律程序和标准的，比如需要由公安机关出具拘留证，明确拘留的期限和地点等。

因此，套牌被查配合调查期间，一般不算作拘留时间。如果你后续被公安机关依法拘留了，那么拘留的时间会从你被实际拘留的那一刻开始计算。

希望这个解释能帮到你。如果你还有其他关于法律方面的问题，或者需要进一步的帮助，可以直接向我提问。