一般纳税人公司可以设立小规模公司，且此行为是合法的。具体分析如下：

1. 从法律角度：我国法律并未禁止一般纳税人公司设立小规模公司的行为。公司根据业务需要和市场情况，可以自主选择设立不同纳税类型的子公司或分公司。只要符合相关法律法规的设立条件，如注册资本、经营范围、公司章程等，就可以合法设立。

2. 从税务管理角度：一般纳税人和小规模纳税人是税务管理上的分类，主要依据公司的年销售额和会计核算水平来确定。一般纳税人公司设立小规模公司后，两者在税务上应分别管理，各自按照其纳税类型的要求进行申报和缴税。

3. 从经营策略角度：一般纳税人公司设立小规模公司可能是出于多种经营策略考虑，如分散经营风险、拓展新业务领域、享受税收优惠政策等。这种设立行为在公司法允许的范围内，且有助于公司灵活应对市场变化。

综上所述，一般纳税人公司设立小规模公司是合法的，但在实际操作中需遵守相关法律法规和税务管理规定，确保合法合规经营。如有具体法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。