双方当事人达成还款协议但未履行，且判决书已过执行期限的情况下，原判决书仍然可以申请强制执行。下面对此进行详细分析：

一. 还款协议与判决书的关系

1. 独立性：还款协议是双方当事人在判决后自愿达成的，它并不取代原判决书的法律效力。即使达成了还款协议，原判决书依然有效，且其确定的权利义务关系依然存在。
2. 执行依据：如果还款协议未得到履行，债权人可以选择依据原判决书向法院申请强制执行，而不是仅仅依赖于还款协议。

二. 执行期限的问题

1. 执行期限的含义：判决书的执行期限通常指的是债权人向法院申请强制执行的期限。这个期限是法定的，旨在保护债权人的权益，同时督促债权人及时行使权利。
2. 过期后的影响：虽然执行期限已过，但并不意味着债权人丧失了申请强制执行的权利。在某些情况下，如果债权人能够证明存在合理的延误原因，法院可能会接受其强制执行申请。

三. 法律建议

1. 尽快行动：尽管还款协议未履行，且判决书已过执行期限，但债权人仍应尽快向法院咨询并申请强制执行。因为时间拖延可能会增加执行难度，甚至导致债权无法实现。
2. 准备证据：在申请强制执行时，债权人需要准备充分的证据，包括原判决书、还款协议以及证明债务人未履行还款义务的相关证据。

综上所述，即使双方当事人达成了还款协议且未履行，同时判决书已过执行期限，债权人仍然有权依据原判决书向法院申请强制执行。我建议债权人尽快采取行动，准备相关证据，并咨询法院的具体执行程序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。