注册监理工程师有在建项目时办理离职，需确保项目交接妥善，并遵循相关法律法规关于劳动合同解除的规定。具体分析如下：
一. 劳动合同解除的法律规定
- 协商一致解除：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。若监理工程师与用人单位就离职事宜达成一致，可依据此条款解除劳动合同。
- 提前通知解除：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若监理工程师决定离职，应提前三十日以书面形式通知用人单位。
二. 在建项目的处理
- 项目交接：注册监理工程师在离职前，应确保所负责的在建项目已经妥善交接。这包括但不限于项目资料、工程进度、质量状况、存在问题及解决方案等。交接过程应有明确的记录，并由交接双方签字确认。
- 后续责任：离职后，若因在建项目出现问题而需要监理工程师承担责任的，应根据具体情况判断。若监理工程师已经按照规定进行交接，且离职后并未参与项目后续工作，则一般不应承担责任。
三. 离职手续的办理
- 出具证明：根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明。监理工程师离职时，应要求用人单位出具相应的离职证明。
- 档案和社会保险关系转移：用人单位还应在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。监理工程师应关注并确认这些手续的完成情况。
- 工资支付：根据《工资支付暂行规定（1994年版）》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。监理工程师应确保离职时工资已经结清。
综上所述，注册监理工程师有在建项目时办理离职，需与用人单位协商一致或提前通知解除劳动合同，并确保在建项目已经妥善交接。同时，应关注离职证明的出具、档案和社会保险关系的转移以及工资的结清情况。我建议您在离职前与用人单位充分沟通，确保所有手续都按照规定办理，以避免后续可能出现的纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。