用人单位与劳动者在三方协议中约定一年内离职需支付违约金，这一约定在劳动者入职并签订劳动合同后自动失效，无需支付违约金。以下是具体分析：
一. 三方协议与劳动合同的关系
三方协议的性质：三方协议是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的协议，允许约定违约金。但高校毕业生凭就业报到证到单位报到、用人单位正式接收后，三方协议自行终止。
劳动合同的效力：劳动者入职后，用人单位应当与其签订劳动合同。劳动合同是双方建立劳动关系的法律依据，其效力高于三方协议。一旦劳动合同签订，三方协议中关于劳动关系的部分自动失效。
二. 离职违约金的法律规定
《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条：除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。即，除了服务期违约和竞业限制违约外，用人单位不得随意约定劳动者承担违约金。
服务期违约：根据《劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与劳动者约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
竞业限制违约：根据《劳动合同法》第二十三条，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，并约定竞业限制条款及违约金。但竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。且用人单位在解除或者终止劳动合同后，需在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
三. 结论与建议
结论：用人单位在三方协议中约定劳动者一年内离职需支付违约金，这一约定在劳动者入职并签订劳动合同后自动失效。除非劳动者违反服务期约定或竞业限制约定，否则无需支付违约金。
建议：
劳动者：在签订三方协议和劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于违约金、服务期、竞业限制等条款。如有不明确或不合理之处，应及时与用人单位沟通协商。
用人单位：应遵守法律法规，不得随意约定劳动者承担违约金。如需约定服务期或竞业限制，应明确约定相关条款，并确保符合法律法规的规定。
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