这样的施工协议条款是不合法的。现在我从法律角度为你详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国合同法》第五十三条，合同中的下列免责条款无效：（一）造成对方人身伤害的；（二）因故意或者重大过失造成对方财产损失的。
   • 同时，《中华人民共和国安全生产法》及相关法律法规也明确规定，生产经营单位对从业人员在生产经营活动中遭受的人身伤害负有赔偿责任。

2. 条款分析：

   • 施工协议中“如造成人员伤亡由乙方负责与甲方无关”的条款，实质上是甲方试图通过合同条款来免除其对乙方或第三方可能因施工活动造成的人身伤害赔偿责任。
   • 这种条款违反了上述法律规定，因为它试图免除一方因人身伤害而应承担的法定责任，这种责任是强制性的，不能通过合同条款来转移或免除。

3. 法律后果：

   • 如果这样的条款被写入合同，并且发生了人员伤亡事故，那么该条款将被视为无效，甲方仍然需要承担相应的赔偿责任。
   • 乙方或受害方可以依据相关法律法规，向甲方主张赔偿权利，包括但不限于医疗费用、误工费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等。

4. 建议：

   • 在签订施工协议时，双方应明确各自的安全责任和义务，确保施工活动的安全进行。
   • 如果遇到类似的不合法条款，应及时提出并协商修改，以避免未来可能的法律纠纷。

综上所述，施工协议中“如造成人员伤亡由乙方负责与甲方无关”的条款是不合法的，因为它违反了相关法律法规的强制性规定。如果你在施工协议中遇到了这样的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询。