当公司因搬迁导致员工有未休的年假时，赔偿问题需根据《职工带薪年休假条例》及相关法律法规来处理。以下是对这一问题的详细解答：
法律依据与赔偿原则
主要依据：
- 根据《职工带薪年休假条例》第五条，若单位因工作需要不能安排职工休年休假，应经职工本人同意，并按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。这里已包含正常工作期间的工资收入，所以实际额外支付的是日工资收入的200%。
劳动合同与公司规定：
- 除了法律法规，赔偿方式还需参考劳动合同及公司内部的具体规定。若公司搬迁导致劳动合同无法继续履行，且双方未能就变更内容达成协议，公司可能还需根据《劳动合同法》支付经济补偿金。
赔偿计算方式
确定应休年休假天数：
- 工作满1年不满10年的员工，年休假为5天；
- 满10年不满20年的员工，年休假为10天；
- 满20年的员工，年休假为15天。
计算日工资收入：
- 日工资按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算，其中月工资是指剔除加班工资后的月平均工资。
计算赔偿金额：
- 应休未休年休假工资报酬（额外支付部分）= 日工资收入 × 未休年休假天数 × 200%。
处理方式与建议
安排休假：
- 公司可在搬迁后的合理时间内安排员工休完剩余的年假。
支付年休假工资：
- 若无法安排休假，公司应按照上述计算方式支付员工未休年假的工资报酬。
与员工协商：
- 公司可与员工探讨将未休年假转化为调休、加班补偿或其他福利形式，但需双方协商一致。
查阅法规与政策：
- 具体赔偿方式和标准可能因地区和公司政策而异，建议查阅当地的劳动法规、公司员工手册及劳动合同的相关条款。
专业咨询：
- 在处理过程中，建议咨询专业法律人士以确保合规性，并保障员工的合法权益。
维权途径
若公司未按规定处理未休年假问题，员工可采取以下措施维权：
与公司协商：首先尝试与公司进行沟通，要求依法处理未休年假问题。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，要求其责令公司限期改正。
申请劳动仲裁：如问题仍未得到解决，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付未休年休假工资报酬及其他相关权益。对仲裁结果不服的，员工可向人民法院提起诉讼。
综上所述，公司在搬迁时应充分考虑员工的未休年假问题，并依据相关法律法规和劳动合同的规定进行合理处理。若公司未能妥善处理，员工有权通过法律途径来维护自身的合法权益。