出租车司机捡到乘客手机不承认，后通过运管处返还，运管处仍可能会对其进行处罚。

一. 分析案情与法律依据

1. 出租车司机的行为性质：出租车司机捡到乘客手机不承认，这一行为可能构成侵占他人财物。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，拾得遗失物，应当返还权利人。拾得人应当及时通知权利人领取，或者送交公安等有关部门。同时，出租车司机作为服务提供者，有义务保管好乘客的财物。

2. 运管处的职责与权限：运管处作为出租车行业的管理部门，有责任对出租车司机的行为进行监督和管理。对于出租车司机的不当行为，运管处有权依据相关法规进行处罚。

3. 处罚的可能性：尽管出租车司机最终通过运管处将手机返还给了乘客，但其最初的不承认行为已经构成了对乘客财物的侵占。因此，运管处仍可能会根据其行为的性质、情节以及相关规定，对出租车司机进行相应的处罚。

二. 推理总结

• 出租车司机捡到乘客手机不承认，违反了拾得遗失物应返还的义务，也违反了出租车司机的职业操守。
• 尽管后来通过运管处将手机返还，但并不能消除其最初的不当行为。
• 运管处作为管理部门，有权对出租车司机的行为进行监督和管理，并依据相关规定进行处罚。

因此，运管处仍可能会对出租车司机进行处罚。如有进一步需要，您可以继续咨询我。