员工没有身份证做了三天就走了，发工资仍然需要申报。以下是详细的分析：

1. 税务申报的必要性：

   • 根据税法规定，企业向员工支付薪酬，无论员工是否具备身份证，都需要按照相关规定进行税务申报。这是企业的法定义务，与员工的身份状态无关。

2. 申报流程：

   • 在申报时，企业应按照实际支付的工资数额，以及相应的税收规定，计算并缴纳应缴税款。
   • 如果员工没有身份证，企业可能无法直接获取其个人税务信息，但这并不影响税务申报的进行。企业可以依据自身的财务记录和支付凭证，进行如实的税务申报。

3. 合规性考虑：

   • 按时进行税务申报，不仅符合税法规定，也是企业合规经营的重要体现。
   • 如果企业因未按规定进行税务申报而受到处罚，将可能面临法律风险和声誉损失。

4. 特殊情况的处理：

   • 如果员工因未提供身份证而导致企业无法为其缴纳社保等费用，企业应与员工进行沟通，明确双方的责任和义务。
   • 在这种情况下，企业可以考虑与员工签订相关协议，以确保双方权益得到保障。

综上所述，即使员工没有身份证且只工作了三天就离职，企业仍然需要按照税法规定进行工资支付的税务申报。这是企业的法定义务，也是合规经营的重要一环。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。