刑事自诉案件与赔偿案件分开起诉，若赔偿案件败诉，刑事自诉不一定会败诉。以下是详细分析：

1. 刑事自诉与民事赔偿的独立性：

   • 刑事自诉主要聚焦于追究被告人的刑事责任，其目的在于对犯罪行为进行惩处，以维护社会的公序良俗和法律秩序。
   • 民事赔偿则是针对被害人因犯罪行为而遭受的损失，要求被告人给予相应的经济补偿，旨在保护被害人的合法权益。
   • 从法律程序角度看，刑事诉讼和民事诉讼有着明确的分工，可以各自独立进行。

2. 赔偿案件败诉对刑事自诉的影响：

   • 赔偿案件的败诉主要关乎民事责任的承担，即被告人是否需要对被害人进行经济赔偿。
   • 刑事自诉案件的胜败则取决于是否能证明被告人实施了犯罪行为，以及该行为是否构成犯罪。
   • 因此，赔偿案件的败诉并不直接影响刑事自诉案件的审理和判决。即使赔偿案件败诉，只要刑事自诉案件中的证据充分、事实清楚，仍然有可能获得胜诉。

3. 特殊情况下的合并审理：

   • 在某些特定情况下，刑事诉讼和民事诉讼可能会合并审理。这通常是为了提高诉讼效率、避免矛盾冲突以及更全面地保护各方权益。
   • 然而，合并审理并非必然，而是要根据法律的具体规定以及案件的实际情况来综合判断。

综上所述，刑事自诉案件与赔偿案件分开起诉时，赔偿案件的败诉并不会直接导致刑事自诉案件的败诉。两者在法律程序上是独立的，各自有着不同的审理标准和判决依据。因此，即使赔偿案件败诉，只要刑事自诉案件中的证据充分、事实清楚，仍然有可能获得胜诉。