事业单位事实用工追回工资并不违法，但具体是否应当追回以及追回的方式需根据实际情况判断。

首先，我们要明确“事实用工”的含义。在事业单位中，如果员工实际上提供了劳动，但并未签订正式的劳动合同，或者劳动合同的内容与实际履行的情况不符，这就构成了事实用工关系。在这种情况下，员工有权要求事业单位按照其实际提供的劳动支付相应的工资。

接下来，我们分析追回工资是否违法的问题。从法律角度来看，劳动者提供劳动后，用人单位应当支付相应的报酬，这是劳动法的基本原则。因此，如果事业单位未按时足额支付工资，员工有权要求追回。这一过程并不违反法律，反而是维护自身合法权益的正当行为。

然而，在具体操作中，追回工资的方式和程序需要遵循法律规定。员工应当通过合法途径，如与事业单位协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式来维护自己的权益。如果采取非法手段或过激行为来追回工资，则可能构成违法行为。

此外，我们还需要考虑一些特殊情况。例如，如果事业单位与员工之间就工资支付存在争议，或者员工在追回工资的过程中提出了不合理的诉求，那么就需要根据具体情况来判断是否应当追回以及追回的具体数额。

综上所述，事业单位事实用工追回工资并不违法，但员工在追回工资的过程中应当遵循法律规定，通过合法途径来维护自己的权益。如果遇到复杂或争议较大的情况，建议咨询专业律师或劳动法律机构以获取更具体的法律建议。