存在重大误解且赔偿金额小于50元的医药费协议，在符合一定条件下是可以撤销的。下面我将详细解释这一结论：
法律背景
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。重大误解，是指行为人因对行为的性质、对方当事人、标的物的品种、质量、规格和数量等的错误认识，使行为的后果与自己的意思相悖，并造成较大损失的情况。
具体分析
重大误解的认定：
- 你需要证明在签订协议时，对协议的内容或相关事实存在重大误解。例如，你可能误以为赔偿金额是500元，而实际上是50元，这种误解如果对你的权益产生了重大影响，就可能构成重大误解。
- 误解的内容必须是协议的主要内容，且这种误解导致了协议的签订与你的真实意思相悖。
赔偿金额的大小：
- 虽然赔偿金额只有50元，但这并不影响你基于重大误解请求撤销协议的权利。法律并没有规定只有达到一定金额的误解才能构成重大误解。
- 关键在于误解是否对你的权益产生了重大影响，以及这种影响是否足以让你有理由请求撤销协议。
撤销协议的途径：
- 如果你认为存在重大误解，可以向人民法院或者仲裁机构提出撤销协议的请求。
- 你需要提供充分的证据来证明存在重大误解，以及这种误解对你的权益产生了重大影响。
法律建议
- 收集证据：首先，你需要收集所有与协议签订相关的证据，包括但不限于协议文本、沟通记录、证人证言等，以证明你在签订协议时存在重大误解。
- 咨询专业意见：虽然我可以为你提供基本的法律解释，但具体的法律事务可能涉及复杂的法律关系和证据问题。因此，我建议你咨询专业的律师，以便更准确地了解你的权益和可能的法律后果。
- 及时行动：如果你认为存在重大误解，应尽快向人民法院或者仲裁机构提出撤销协议的请求，以免错过法律规定的时效期限。
综上所述，存在重大误解且赔偿金额小于50元的医药费协议，在符合一定条件下是可以撤销的。但你需要收集充分的证据来证明存在重大误解，并及时向人民法院或者仲裁机构提出撤销协议的请求。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。