员工上一天班12小时休息一天，在一般情况下是不合法的。但具体是否合法，还需根据具体的工作制度和劳动行政部门的批准情况来判断。下面我将详细解释这一结论：

一、一般情况下的不合法性

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。因此，要求员工每天工作12小时，显然超出了法定的每日工作时间上限，构成违法行为。

二、特殊情况下的合法性分析

然而，在某些特殊情况下，员工每天工作12小时可能是合法的，这主要取决于工作制度的安排和劳动行政部门的批准情况。

1. 综合计算工时工作制：

   • 部分企业因工作性质特殊，如连续作业或受季节及自然条件限制，可采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的工时制度。
   • 在此制度下，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时，但综合计算周期内的总实际工作时间不得超过总法定标准工作时间。
   • 企业实行此类工时制需经过劳动行政部门的审批，否则仍属违法。

2. 不定时工作制：

   • 对于企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员等因工作无法按标准工作时间衡量的职工，可实行不定时工作制。
   • 在此制度下，企业可不执行每日工作不超过8小时的规定，但也需经过劳动行政部门审批。

3. 加班的合法性：

   • 用人单位因生产经营需要，可与工会和劳动者协商后延长工作时间，但一般每日不得超过1小时；特殊原因下每日不得超过3小时，且每月不得超过36小时。
   • 超出此范围的加班均属违法，即使与劳动者协商一致也不能违反法律规定。

三、法律责任与救济途径

若用人单位违法安排劳动者延长工作时间，劳动者可向劳动行政部门投诉，由劳动行政部门给予警告、责令改正，并可处以罚款。同时，劳动者有权要求用人单位支付相应的加班工资，标准为不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。

综上所述，员工上一天班12小时休息一天，在一般情况下是不合法的。企业应严格遵守法律法规，合理安排员工的工作时间和休息时间，保障劳动者的合法权益。在特殊情况下，如需延长工作时间，应确保符合法律规定并经过相应审批程序。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。