关于拖拉机非法营运由谁来管的问题，我可以明确告诉你，这主要由交通运输管理部门，也就是通常所说的运管部门来负责。下面我会详细解释这个问题，并从多个角度给出分析。

1. 管理部门：

   • 拖拉机非法营运属于道路运输领域的违法行为，根据相关法律法规，交通运输管理部门是负责道路运输市场监管的主要机构。
   • 他们有权对非法营运行为进行查处，包括拖拉机在内的各种非法营运车辆。

2. 法律依据：

   • 《中华人民共和国道路运输条例》等法律法规明确规定了交通运输管理部门的职责和权限，包括对非法营运行为的查处。
   • 这些条例通常详细列明了非法营运的定义、处罚措施以及执法程序等。

3. 处理流程：

   • 交通运输管理部门在发现拖拉机非法营运后，会依法进行查处。
   • 查处过程可能包括现场检查、询问当事人、收集证据等程序。
   • 一旦确认非法营运行为，管理部门将依法对当事人进行处罚，如罚款、暂扣车辆等。

4. 相关建议：

   • 如果你发现拖拉机存在非法营运行为，可以向当地的交通运输管理部门举报。
   • 在举报时，尽量提供详细的证据和线索，如车辆照片、营运时间、地点等，以便管理部门能够迅速有效地进行查处。

综上所述，拖拉机非法营运主要由交通运输管理部门来管。他们依据相关法律法规对非法营运行为进行查处，并维护道路运输市场的秩序。如果你有相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。