非法营运行为主要由县级以上道路运输管理机构负责管理和处罚，交警部门在特定情况下会予以协助，但并非主要管理机构。以下是对这一问题的详细分析：

一、非法营运的定义与性质

非法营运是指未依法取得营运权而擅自从事道路运输经营的行为，即未按规定领取有关主管部门核发的营运证件或超越核定范围进行经营。这种行为不仅扰乱了正常的道路运输市场秩序，还可能对乘客的安全构成严重威胁。

二、各部门职责分工

1. 交警部门：

   • 主要职责：交警部门主要负责维护道路交通秩序，保障道路交通安全，处理交通事故等与道路通行安全直接相关的事务。他们负责查处机动车驾驶员的交通违法行为，如闯红灯、超速、酒驾等，并管理道路交通设施，确保道路的正常通行。
   • 在非法营运中的角色：虽然交警部门不直接管理非法营运，但在执勤过程中可能会发现并处理一些涉嫌非法营运的车辆。例如，在联合执法行动中，交警会协助道路运输管理机构拦截、检查涉嫌非法营运的车辆，确保执法过程的安全和顺畅。如果非法营运车辆同时存在交通违法行为，交警还可以依据《中华人民共和国道路交通安全法》对这些交通违法行为进行相应的处罚。

2. 交通运输部门（道路运输管理机构）：

   • 主要职责：交通运输部门是负责查处非法营运行为的主要机构。他们依据《中华人民共和国道路运输条例》对非法营运行为进行查处，包括责令停止经营、没收违法所得以及处以罚款等。其目的是规范运输市场秩序，保障合法经营者的权益，以及乘客的安全和利益。
   • 管理与执行：由县级以上道路运输管理机构负责责令停止经营，并依据相关法规进行处罚。对于未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，有违法所得的，没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

三、交警与道路运输管理机构的协作

• 一般情况：交警部门不直接管理非法营运，但在执勤过程中可能会发现并处理一些涉嫌非法营运的车辆，此时会将其移交至道路运输管理机构进行进一步处理。
• 特殊情况下的协同执法：在某些特殊情况下，如整治交通秩序的统一行动中，交警部门会配合道路运输管理机构开展联合执法行动，共同查处非法营运车辆，提供必要的支持和保障。

四、建议与总结

为维护道路运输市场的正常秩序和乘客的安全，建议车主严格遵守相关法律法规，不要从事非法营运活动。同时，公众也应积极举报非法营运行为，共同维护良好的交通秩序和市场环境。如果您遇到非法营运相关的问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。