当行政处罚调查取证过程中当事人不配合时，行政机关可采取以下措施应对：

1. 明确告知义务与后果：

   • 向当事人详细解释调查的目的、依据以及不配合调查可能带来的法律后果，消除其疑虑和抵触情绪。
   • 明确指出当事人有义务配合行政机关的调查工作，这是法律规定的责任和义务。如果拒绝配合或阻挠调查，将承担相应的法律责任，如可能面临罚款、拘留等行政处罚。

2. 采取合法强制措施：

   • 在必要时，行政机关可依法对当事人采取强制措施，如强制传唤、查封、扣押等，以确保调查的顺利进行。但需严格依法进行，避免侵犯当事人的合法权益。
   • 若当事人拒不配合且情节严重，构成妨碍公务等违法行为时，行政机关可依法向公安机关报案，由公安机关处理；涉及刑事犯罪的，还可移送司法机关追究刑事责任。

3. 完善证据收集方式：

   • 通过现场勘查、询问相关人员、调取监控录像等多种方式，全面收集与案件有关的证据材料。
   • 利用现代科技手段，如电子数据取证、远程视频询问等，提高取证的效率和准确性。即使当事人不配合，也能确保调查工作的正常推进。

4. 规范执法程序与保障救济权利：

   • 严格遵循法定程序，包括出示证件、表明身份、制作笔录等环节，确保执法的公正性和合法性。
   • 在作出行政处罚决定前，充分听取当事人的意见和申辩，并记录在案，保障其陈述申辩权。
   • 告知当事人如对处罚决定不服，有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。

综上所述，面对行政处罚调查取证过程中当事人的不配合，行政机关应依法采取多种措施，既确保调查的顺利进行，又保障当事人的合法权益。如你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。