两年分居并不直接影响抚养权的判定，法院会综合考虑多方面因素来决定抚养权的归属。

在婚姻家庭法中，抚养权的判定是基于最有利于未成年子女的原则。分居两年虽然是诉讼离婚时认定夫妻感情破裂、请求判决离婚的理由之一，但它并不直接决定抚养权的归属。法院在判定抚养权时，会综合考虑父母双方的抚养能力、条件以及孩子的实际情况。

1. 对于不满两周岁的子女，通常归母亲直接抚养，除非母亲不宜抚养。

2. 对于已满两周岁的子女，法院会综合考虑父母双方的抚养能力和条件，如经济状况、生活环境、感情亲疏等。如果一方有绝育、丧失生育能力等情况，可能会优先考虑该方。

3. 对于已满八周岁的子女，法院会尊重其真实意愿。

因此，即使分居两年，如果一方在抚养能力、条件等方面更具优势，且能证明自己更适合抚养孩子，那么仍然有可能获得抚养权。在争取抚养权时，建议积极举证，证明自身条件更适合抚养孩子，以增加获得抚养权的可能性。

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