国有土地使用证是由县级以上人民政府颁发的。具体来说，根据《土地管理法》的相关规定，单位和个人依法使用的国有土地，需要由县级以上人民政府进行登记造册，并核发证书以确认使用权。这一流程确保了土地使用权的合法性和权威性。

在实际操作中，国土资源部门通常负责具体的土地登记和证书发放工作。他们依据相关法律法规和政策，对土地使用权的申请进行审核，并在确认无误后颁发国有土地使用证。这一证书是土地使用者合法权益的重要凭证，也是进行土地交易、抵押、出租等活动的必要依据。

此外，值得注意的是，土地证书的印制和管理也有严格的规定。根据《土地证书印制管理办法》，国土资源部负责土地证书印制的监督管理，并委托有关单位开展土地证书印制企业资格认定和印制发行工作。这进一步保障了土地证书的真实性和有效性，防止了假冒伪劣证书的出现。

综上所述，国有土地使用证是由县级以上人民政府颁发的，具有法律效力和权威性。在办理相关手续时，建议咨询当地国土资源部门或相关部门，以获取最准确的信息和指导。