当您发现自己在两个城市重复缴纳了医疗保险时，您可以申请退费。不过，需要注意的是，退费的具体操作可能因地区和医保政策的不同而有所差异。以下是一般性的申请退费步骤和建议，供您参考：

一、明确重复参保的情况

首先，您需要确认自己确实存在重复参保的情况。重复参保通常指的是在同一时间段内，您在同一基本医疗保险制度或不同基本医疗保险制度下有多条参保缴费状态正常的记录。例如，您可能在户籍地和常住地分别参加了城乡居民医保，或者同时参加了职工医保和城乡居民医保。

二、选择保留的参保关系

根据您的实际情况，选择需要保留的参保关系。一般来说，如果您在单位工作并参加了职工医保，那么建议保留职工医保；如果您是城乡居民，且没有稳定的工作单位，那么可以选择保留城乡居民医保。在做出选择后，需要终止其他重复的参保关系。

三、申请退费

1. 联系医保经办机构：您需要联系您想要退费的医保经办机构（可能是户籍地的医保局或常住地的医保局），咨询退费的具体流程和所需材料。

2. 准备相关材料：根据医保经办机构的指导，准备相关的退费申请材料。这些材料可能包括您的身份证、医保缴费凭证、重复参保的证明等。

3. 提交申请：将准备好的材料提交给医保经办机构，并填写退费申请表。在提交申请时，请确保您的个人信息和退费原因填写准确、完整。

4. 等待审核：医保经办机构会对您的退费申请进行审核。审核通过后，他们会将退费金额打入您指定的银行账户或按照其他方式退还给您。

四、注意事项

• 退费申请可能需要在一定的时间范围内提出，具体时限请咨询当地的医保经办机构。
• 退费金额可能不包括您已经享受过的医保待遇部分。
• 在申请退费前，请确保您已经终止了重复的参保关系，以避免继续产生不必要的缴费。

五、特殊情况处理

如果您是通过网上税务局等电子渠道缴纳的医保费用，并且出现了重复缴费的情况，您也可以尝试通过电子税务局的退费申请功能进行在线申请。具体操作流程请参考当地的电子税务局操作指南或咨询税务局的工作人员。

总之，申请医保重复缴费的退费需要您与当地的医保经办机构或税务局进行沟通和协商。希望以上建议能对您有所帮助！