村股份经济合作社在开具增值税发票的问题上，主要需依据其是否销售免税货物以及是否为增值税一般纳税人来确定。

首先，根据相关规定，如村股份经济合作社销售的是本社成员生产的农业产品，这类销售通常视同农业生产者销售自产农业产品，是免征增值税的。在这种情况下，合作社不得开具增值税专用发票。这是因为增值税专用发票是专门用于增值税一般纳税人在销售应税货物或提供应税劳务时开具的，而免税货物不属于应税范围，因此不能开具此类发票。

其次，如果村股份经济合作社并非仅销售免税货物，还有其他应税销售行为，并且已经被认定为增值税一般纳税人，那么它在销售这些应税货物或提供应税劳务时，是可以开具增值税专用发票的。这是因为增值税专用发票是增值税计算和管理中的重要凭证，既作为纳税人反映经济活动中的重要会计凭证，又是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明。

综上所述，村股份经济合作社能否开具增值税发票，取决于其具体的销售行为和税务身份。如果它主要销售免税货物，如本社成员生产的农业产品，那么它不能开具增值税专用发票。但如果它有应税销售行为，并且已经被认定为增值税一般纳税人，那么它在销售这些应税货物或提供应税劳务时，是可以开具增值税专用发票的。