拼多多商家在消费者退回的商品不是本店商品的情况下，可以驳回退款申请。

在处理此类情况时，商家应遵循以下步骤和注意事项：

1. 核实商品信息：

   • 商家应首先仔细核对消费者退回的商品信息，包括商品名称、规格、型号等，确保退回的商品确实不是本店的商品。

2. 与消费者沟通：

   • 在确认商品信息不符后，商家应及时与消费者进行沟通，了解退货的具体原因，并尝试协商解决方案。可以提醒消费者检查是否寄错了商品，或者是否在其他店铺购买了相似商品并混淆了退货信息。

3. 驳回退款申请：

   • 如果经过沟通确认，消费者退回的商品确实不是本店的商品，商家可以在拼多多后台的退款管理页面选择驳回退款申请。
   • 驳回时，应明确填写驳回理由，如“退回商品非本店销售商品”，并附上相关证据，如商品照片、物流信息等，以证明退回的商品与商家无关。

4. 提交驳回申请并等待审核：

   • 填写完驳回说明和证据后，提交驳回申请。平台会对商家的驳回申请进行审核，并根据实际情况作出处理决定。

5. 注意事项：

   • 商家在驳回退款申请时，务必确保自己的行为合法合规，避免侵犯消费者的合法权益。
   • 提供的证据应真实、客观、全面，能够清晰地反映事实情况。
   • 商家应及时处理消费者的退款申请，并在规定时间内给予回复，以避免不必要的纠纷和风险。

综上所述，拼多多商家在消费者退回的商品不是本店商品的情况下，有权驳回退款申请。但商家在处理此类情况时，应务必谨慎操作，确保合法合规，并提供充分且有效的证据来支持自己的驳回理由。如果商家在处理过程中遇到任何问题或纠纷，可以及时向平台寻求帮助或咨询专业律师。