高于最低工资标准支付工资，在大多数情况下是合法的，但这并不意味着只要工资高于最低工资标准，用人单位的所有工资支付行为就都合法。以下是对这一问题的详细解答：

一、高于最低工资标准的合法性

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条的规定，国家实行最低工资保障制度，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。因此，高于最低工资标准支付工资是符合法律规定的。

2. 意义：高于最低工资标准支付工资，有助于提升劳动者的生活水平，激发其工作积极性，同时也是用人单位吸引和留住人才的一种手段。

二、需注意的合法性问题

虽然高于最低工资标准支付工资本身是合法的，但用人单位在支付工资时还需注意以下合法性问题：

1. 工资构成：工资总额应包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。用人单位应确保劳动者的工资总额不低于当地最低工资标准，而不仅仅是基本工资部分。

2. 扣款规定：用人单位在扣除劳动者工资时，应遵守相关法律法规。例如，因劳动者原因造成经济损失需赔偿的，每月扣除额不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

3. 加班工资：对于加班工作，用人单位应按照法律规定支付加班工资，且加班工资的计算基数不得低于当地最低工资标准。

4. 试用期工资：劳动者在试用期的工资也不得低于本单位相同岗位最低档工资的80%或者不得低于劳动合同约定工资的80%，同时也不得低于用人单位所在地的最低工资标准。

三、劳动者权益保障

如果用人单位违反法律规定，支付低于最低工资标准的工资，劳动者可以采取以下措施维护自身权益：

1. 协商：首先尝试与用人单位协商，要求纠正并补足差额。

2. 投诉：向当地劳动监察部门投诉，由其进行监督检查并责令改正。

3. 仲裁与诉讼：如果协商和投诉均无果，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位补足工资差额及可能的经济补偿。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

综上所述，高于最低工资标准支付工资本身是合法的，但用人单位在支付工资时还需遵守相关法律法规，确保工资支付行为的合法性。同时，劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取相应措施维护自身权益。