公司员工在休长年病假期间是有工资的，但具体数额会根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限而有所差异，且需遵循相关法律法规的规定。下面我为您详细解析：
法定医疗期内的工资支付：
- 医疗期规定：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，可享受的医疗期从三个月到二十四个月不等，具体取决于个人实际参加工作年限和在本单位工作年限。
- 工资标准：在法定医疗期内，企业应当支付病假工资或疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%。
超过法定医疗期的处理：
- 若员工超过法定医疗期仍无法正常工作，且不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位有权解除劳动合同，并不再支付工资，但需依法支付经济补偿。
- 在某些情况下，用人单位出于人道主义或与员工达成一致，可能会继续支付一定的生活补助，但这不是法律强制要求的。
病假工资制度的合法性与合理性：
- 公司在制定病假工资制度时，必须遵守相关法律法规，确保制度的合法性和合理性。
- 病假工资制度的制定应经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
举例说明：
假设小李在A公司工作了5年，实际工作年限为8年。根据规定，他患病后可享受6个月的医疗期。在这6个月内，A公司应支付给他的病假工资不能低于当地最低工资标准的80%。若6个月医疗期满后，小李仍不能工作，A公司在支付相应经济补偿后，有权解除与他的劳动合同，此后便无需再支付工资。
行动建议：
- 如果您或您身边的人正在休长年病假且对工资支付有疑问，建议首先查阅公司关于病假工资的具体规定，并与人力资源部门沟通确认。
- 如遇公司不按规定支付病假工资的情况，可以保留相关证据，通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他法律问题，欢迎随时向我咨询。