没收到货但显示已签收，申请仅退款商家不同意时，您可以按照以下步骤处理：

1. 保留证据：

   • 首先，保留好与商家的聊天记录、订单详情、物流信息等，这些证据能证明您未收到货物以及与商家就退款问题进行过沟通。

2. 与商家再次沟通：

   • 尝试与商家再次沟通，明确表示您未收到货物，有权申请退款，并要求商家处理。同时，保留好这次沟通的聊天记录作为后续维权的证据。

3. 向电商平台投诉：

   • 若与商家沟通无果，您可以向电商平台投诉。提供订单信息、未收到货的证明以及与商家的沟通记录等资料，由平台介入调解。电商平台通常有消费者保障机制，会协助您处理此类问题。

4. 向消费者协会或相关监管部门投诉：

   • 如果平台调解不成，您可以向消费者协会或有关行政部门投诉。详细说明交易情况、卖家信息和自身诉求，请求其协助维护您的合法权益。

5. 考虑法律途径维权：

   • 若上述途径均无法有效解决，且您的损失较大，可以考虑通过法律途径维权。向法院提起诉讼，要求商家退款并承担因未履行交货义务给您造成的损失。在提起诉讼前，请确保已准备好充分的证据材料。

综上所述，当您没收到货但显示已签收，且商家不同意退款时，应首先保留好相关证据，然后与商家沟通、向电商平台投诉、向消费者协会或相关监管部门投诉，最后考虑法律途径维权。在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。